一位教授(和他的班级)为一项有1000名作者的进化研究做出了贡献
你得仔细看才能在这张纸上找到Matthew Wawersik的名字。作者及其所属机构的名单有四页之多。
但他就在这里,在第一页的底部附近,他是1000多名研究人员之一,他们为“果蝇穆勒F元素在4000万年的进化中保持了一组独特的基因组特性”做出了重大贡献,发表在G3杂志上:基因,基因组,遗传学。
威廉玛丽大学生物系的副教授Wawersik说,这个项目的实际贡献者数量可能是这个数字的四倍。
成千上万的人一起做一个项目?这是怎么发生的?
这种超级作者合作在科学领域变得越来越普遍。欧洲核子研究中心(CERN)的一组物理学家最近打破了多作者论文的记录,他们的论文包含了5000多名作者的名字。
如此广泛的合作是由于许多相互关联的原因而产生的。首先,今天的许多科学问题超出了一个人甚至一小群科学家的能力范围。其次,基因组学研究或高能物理实验等复杂调查产生的大量数据绝对需要大量科学家进行处理。最后,数据可以数字化并远程共享。
互联网和万维网都是为了让科学家共享数据而诞生的。Wawersik解释说,将许多人的思想集中在一个项目上的能力是计算机研究新时代带来的优势之一。计算机运算意味着实验人员在计算机上处理数据。这个术语是互联网时代对体外(在玻璃下,如培养皿中)和体内(在体内)进行的研究概念的延伸。计算机方法特别适合基因组学研究,比如G3论文,它研究了存在于某些种类果蝇中的一种特别持久的染色体。
本文对四种不同种类果蝇的第4条染色体的遗传结构进行了比较研究。Wawersik注意到Muller F染色体不同于果蝇基因组中的其他三条染色体,因为它是异色的,或者说是高度浓缩的。
“这被称为点染色体,它包含大约80个基因,”他说。这只是果蝇15000个基因中的一小部分。Wawersik补充说,Muller F染色体的一个有趣的方面是,尽管它处于“非标准”状态,但点染色体内的80个基因仍然在工作,产生蛋白质——换句话说,基因表达。
他说:“这些基因中有许多具有所谓的‘管家功能’,可以让苍蝇活下去。”
穆勒F的另一个有趣之处在于它的持久性。Wawersik说,在超过4000万年的时间里,点染色体在许多果蝇物种的基因组中几乎保持完整。
“这篇论文基本上是许多人深入研究这些基因组的工作,看看它们是什么样子的,”他解释说。“你可以用一个基因组的样本来做这件事。但是当你谈论穆勒F时,它在4000万年的进化过程中高度保守,观察多个物种可以让你检查控制基因调控的共同主题,并发现物种之间的微妙差异。”
Wawersik提到的“很多很多人”包括一大批本科生,包括他2009年春季学期的基因组学和功能蛋白质组学课程的成员。
BIOL 404每次的入学人数大约是10到12名学生,Wawersik说,每节课都有助于更大规模的研究,比如Muller F的论文。所有这些大型研究都是由位于圣路易斯华盛顿大学的基因组学教育小组组织和协调的。
“实际上是莎拉·埃尔金在管理这个项目。她是一种自然的力量,”他说。
这项以华盛顿大学为基础的多机构合作得到了霍华德休斯医学研究所(HHMI)大学预科和本科科学教育教授计划、美国国立卫生研究院和美国国家科学基金会的大力支持。
Wawersik的BIOL 404课程是威廉玛丽学院众多课程之一,是课堂教学和研究参与之间的桥梁。当然,其他学校也有类似的课程,Wawersik和其他基因组学教育小组的参与者合作撰写了论文,强调了这些项目的教育效益。
这种在计算机上的合作对于那些拥有小型生物系的社区学院或学校来说尤其有吸引力,因为这些学校没有湿佳博体育设施来维持果蝇项目:“你所需要的只是一个带着笔记本电脑的学生,”他说。
“不是每个人都有我在威廉玛丽的佳博体育。我很荣幸能把我的学生带到佳博体育,在我的监督下做有指导意义的研究项目,”瓦沃西克解释说。“这让那些没有设备的机构有机会为学生提供一个真正的研究项目。”