CrimD进入了聚光灯下
“匹兹堡大学格雷厄姆·哈特富尔的佳博体育联系了我们,”威廉玛丽事务所的玛格丽特·萨哈说 生物系。“他们认为我们的‘奥斯卡提名者’非常有趣,非常独特,所以我们有机会与他们合作。”
CrimD是去年由一群大一新生发现的,他们参加了由霍华德休斯医学研究所(HHMI)的科学教育联盟赞助的一年级学生特别研究体验。从校园地标克里姆戴尔(Crim Dell)的泥浆中提取的CrimD,被确定为一种以前未知的噬菌体,一组感染细菌的病毒。
去年,大约30名一年级学生参与了HHMI噬菌体佳博体育,与萨哈和她的微生物学家同事马克·福赛斯(Mark Forsyth)和库尔特·威廉姆森(Kurt Williamson)组成的教师团队合作。哈特福是皮特大学的HHMI教授,自从对CrimD病毒进行测序以来,他一直对该病毒很感兴趣。
在数十所大学的HHMI噬菌体研讨会上发现的众多新噬菌体中,有几件事使CrimD脱颖而出。由于噬菌体不能有性繁殖,所以它们不属于林奈“科属-种”分类,而是被归类为集群。
“这就是CrimD如此有趣的原因;它不在任何先前存在的集群中,”威廉姆森说。“它与一种叫做TM4的噬菌体形成了自己的结构,这种噬菌体在多年前就被测序了,只是单独存在,没有聚集。TM4、CrimD和另一种叫做当归的噬菌体形成了自己的集群。”
对CrimD及其集群伙伴的兴趣不仅仅是学术上的。它们都感染不同种类的分枝杆菌,这个家族包括一组疾病的病原体,包括结核病和麻风病。
“CrimD可能会感染很多令人兴奋的东西 结核分枝杆菌因此,作为一种治疗剂有真正的好处,或者更有可能的是,通过基因操作来帮助找到更好的结核病治疗方法,”威廉姆森解释说。
三位William & 玛丽生物学家正在与去年新生噬菌体佳博体育的六位校友合作。福赛斯解释说,这项工作之所以在皮特大学进行,是因为哈特富尔的佳博体育拥有生物安全三级认证,可以研究对人类有害的病原体,比如肺结核。
威廉和玛丽的研究小组将继续与CrimD合作,清理病毒DNA测序中的粗糙点,并重新注释基因测序蓝图中的基因组。参与的学生包括艾莉森·珀兹、希拉里·惠兰、科比·戈登、吉莉安·沃尔顿、阿瑞卡·杰克逊和乔丹·邦兹·哈德森。
“学生们在做所有的工作。一切!他们在重新注释。他们会做实验。”萨哈说。“我们只是在监督它。”