从零到合著不到三年
William & 玛丽的第一个新生噬菌体佳博体育已经展示了可能是科学界已知的最简单的学习曲线:在不到三年的时间里,从零到在同行评议的期刊上发表共同作者。在此过程中,科学家们发现了一种以前不为科学所知的生命形式——一种生物,目前正在研究它是否可能成为对抗结核病的生物工具。
它始于2008年秋天,一个新生佳博体育专门研究一组被称为噬菌体的病毒。威廉玛丽大学是霍华德休斯医学研究所的科学教育联盟选出的12所大学之一,参加了一项旨在通过向最年轻的大学生介绍真实的研究经验来重振科学教育的倡议的第一年。
在为期一年的噬菌体佳博体育中,每个学生收集、分离并分析一种噬菌体。小组中的一个被提交给商业佳博体育进行基因组测序。参与研究的教师表示,在同行评议的期刊上发表论文,突显了“通过研究教学”原则的成功。
“我们的工作原则是:我们的教育目标和我们的研究目标之间没有任何区别,”威廉玛丽学院的多曼家族杰出生物学副教授马克·福赛斯解释说。“完成教育目标的最佳方式是着手进行真正的发现研究。这篇论文最终证明了这一原理是可行的。”
今年1月,2008年成立的噬菌体佳博体育的参与者加入了他们的合作者——包括他们的三位教师导师——作为一篇论文的共同作者,发表在同行评议的《公共科学图书馆·综合》杂志上。这篇论文是对HHMI噬菌体佳博体育研究的噬菌体基因组的检查。它包括CrimD的特征,CrimD是由第一个噬菌体佳博体育从威廉玛丽大学校园地标Crim Dell的淤泥中发现和分离的新噬菌体。
威廉和玛丽的学生作者“扩大分枝杆菌噬菌体的多样性:对基因组结构和进化的见解”是希拉里M.惠兰12,科比C.戈登12,塞缪尔E.哈维12,Arrykka S.杰克逊12,莫莉J.麦克多诺12,艾莉森M.佩尔茨12和吉莉安M.沃尔顿11。福赛斯与生物学校长玛格丽特·萨哈(Margaret Saha)和生物学助理教授库尔特·威廉姆森(Kurt Williamson)共同撰写了该论文。
威廉姆森是一名病毒学家,是研究噬菌体和其他病毒的专家。他说,HHMI选择噬菌体作为研究重点受到了启发。“这是一个很好的模式,”威廉姆森说。“目标是了解基因组测序和基因组注释-换句话说,基因在哪里以及基因编码什么。噬菌体的好处是它们相当小。它们只有40到100个基因,你必须弄清楚它们的作用。对于一个必须在两个学期内完成的项目来说,这是一个很大的好处。”
HHMI已经资助了为期一年的新生噬菌体佳博体育的三个队列,Saha说W&M将继续并扩大噬菌体佳博体育。除了新生噬菌体佳博体育外,还将提供一个新的高级佳博体育,使学生能够通过与威廉玛丽大学玛格丽特·汉密尔顿化学教授j.c. Poutsma的质谱佳博体育的新合作课程,将他们的病毒研究推向下一个阶段。萨哈指出,建立“延续”佳博体育的想法实际上是由第一批学生阿瑞卡·杰克逊(Arrykka Jackson)提出的,他在那年年底问:“就这样了吗?我们不能继续吗?”
“生物学家对噬菌体进行排序,然后给出遗传密码。基本上,基因所做的就是编码一堆蛋白质,”普茨玛说。“在新的高级佳博体育,我们将尝试确定这些蛋白质是什么。我们要把它们切碎,放到质谱仪里称重。这就是我们从遗传学转向蛋白质组学的方式。”
萨哈说,噬菌体佳博体育是她来到威廉玛丽大学以来参与过的最令人兴奋的事情。“这让学生们以一种深刻而持久的方式兴奋起来。这个噬菌体佳博体育的概念对HHMI来说是一个很大的风险。这对威廉玛丽来说也是一个很大的风险,因为以前从来没有做过这样的事情,”她说。“这带来了巨大的回报。”